同年命令僧薛怀义率令万多人，毁乾元殿，建明堂，了近一年落成。高二百九十四尺，阔三百尺。共三层。上为圆盖，有条九龙作捧着的姿态。上有铁凤，高一丈。饰以黄金，称为万象神宫。
明堂既成，又命僧薛怀义铸大像，大像的小指也可以容纳数十人，於明堂北起五层高的天堂来收纳这个大像。所费用以万亿计，『政府』财政为之枯竭。
是年武承嗣命人凿白石为文曰：圣母临人，永昌帝业。号称在洛水中发现，献给武后，武后大喜，命其石曰宝图。之后武后加尊号为圣母神皇。
武后当政期间进一步发展科举制度。贞观年间共录取进士205人，高宗武后统治期间共录取一千余人。平均每年录取人数比贞观时增加一倍以上。武后载初元年（690）武后在洛城殿对贡士亲发策问，是殿试之始。
是年遣存抚使十人巡抚诸道，举人材，一年后共举一百余人，武后不问出身，全部加以接见，量才任用，或为试凤阁（中书省）舍人、给事中，或为试员外郎、侍御史、补阙、拾遗、校书郎，试官制度自此始，时人有补阙连车载，拾遗平斗量，把侍御史，腕脱校书郎。之语。武后虽以官位收买人心，但对不称职的人亦会加以罢黜；明察善断，故当时的人亦乐於为武后效力。
次年，僧法明等撰
由於误中吐蕃伏兵，全军覆没。接着，武氏再派武攸宜、王孝杰等率兵讨伐，均大败而归。
神功元年（697），武则天又派武懿宗、娄师德、沙吒忠义率兵二十万，讨伐契丹。孙万荣兵败被杀，契丹余众归降於突厥。
神功元年（697）武氏使武懿宗审讯刘思礼谋反事，武魏宗说只要刘思礼指出哪些朝士有分谋反，就免其死罪，於是刘思礼诬告宰相李元素、孙元亨等三十六家海内名士，皆遭灭族，亲旧连坐流窜者千余人。时人以为武懿宗之残暴仅次於周兴、来俊臣。
是年，来俊臣欲罗告武氏诸王及太平公主（中宗之妹，武则天唯一长大成人的亲生女儿），又欲诬皇嗣（唐睿宗）及庐陵王（唐中宗）与南北衙共同谋反，拟一网打尽。
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武氏诸王与太平公主都十分害怕，共同揭发其罪行，下狱处以极刑。仇家争食其肉，不一会就食尽。来俊臣凶狡贪暴网罗辜，织成反状，杀人不可胜计。赃贿如山，冤魂塞路，武后亦知天下愤怨，下令数他的罪状，并没收其家财。
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